Ingénieur de recherches H/F en analyses computationnelles appliquées à la biologie des cancers pédiatri

Vos missions en quelques mots

Missions : Nous recrutons un(e) ingénieur(e) en analyses de données et approches computationnelles pour travailler sur un projet mêlant biologie du développement et cancérologue pédiatrique. Le poste s’inscrit dans un projet collaboratif européen (ERC SYNERGY), qui a pour but d’étudier le rôle du réseau d’interacteurs des récepteurs UNC5 dans le neuroblastome. La principale mission consistera à développer des modèles in silico du fonctionnement de l’interactome UNC5, à partir de données d’analyses transcriptomiques et protéomiques, et des comportements fonctionnels, générées sur un modèle embryonnaire de transplantation in vivo de cellules tumorales humaines dans leur territoire d’émergence.

Activités : -Développement de modèles computationnels : Créer des modèles pour analyser des données de Single-nucleus RNA-seq liées au réseau UNC5. -Mise en œuvre d'outils d'IA : Modéliser l'impact de perturbations d’expression des gènes du réseau UNC5 sur la biologie du neuroblastome. -Collaboration avec des biologistes : Interpréter les résultats in silico et orienter la conception d'expériences in vivo.

Contexte de travail : Le personnel recruté travaillera au sein d’une unite de recherches de 11 équipes, localisée sur le campus de Rockefeller, en proximité immédiate de plusieurs hôpitaux et autres centres de recherches. Il sera intégré dans un collectif de 5 personnes environ au sein d’une équipe de 15 personnes. L’équipe travaille sur l’étude du neuro-développement physiologique et ses dérégulations dans les tumeurs pédiatriques.

Profil recherché

Competences : Formation : Formation initiale en mathématiques appliquées à la biologie et en intelligence artificielle. Une expérience confirmée dans l’application de ces expertises en cancérologie pédiatrique sera un atout fort. Une connaissance de l’inférence de réseaux de régulation génique (GRN) serait un autre avantage important.

Compétences techniques : Maîtrise de R/Python et des outils d’analyse single-cell (Seurat, CellChat, GSEA…). Une connaissance des bases de données biologiques serait un avantage (UniProt, STRING, Alphafold…). La maîtrise de l’anglais (lu, écrit et parlé) est indispensable.

Qualités personnelles : Rigueur, autonomie, prise d’initiative et capacité à travailler en équipe pluridisciplinaire. Un intérêt pour la biologie et la recherche translationnelle sont des atouts.

Contraintes et risques : Pas de risques particuliers

Niveau d'études minimum requis

• Niveau Niveau 7 Master/diplômes équivalents

• Spécialisation Sciences naturelles (biologie-géologie)

Langues

• Français Seuil

Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Vacant

Experte / Expert en expérimentation, instrumentation et techniques biologiques